Φυσικός κύκλος στην εξωσωματική γονιμοποίηση χαρακτηρίζεται ο κύκλος που πραγματοποιείται χωρίς καθόλου χορήγηση φαρμακευτικής αγωγής. Σε αντίθεση, λοιπόν, με ένα κλασικό κύκλο εξωσωματικής γονιμοποίησης, όπου χορηγούνται ενέσιμα φάρμακα για να διεγείρουν τις ωοθήκες και να παράγουν πολλά ωάρια, σε ένα φυσικό κύκλο σκοπός είναι, μετά από κατάλληλη παρακολούθηση, να συλλέξουμε το ένα ωάριο που η γυναίκα θα παράγει έτσι κι αλλιώς μόνη της και να το γονιμοποιήσουμε στο εργαστήριο. Το πρώτο μωρό που γεννήθηκε μετά από εξωσωματική γονιμοποίηση, ήταν αποτέλεσμα ενός επιτυχημένου φυσικού κύκλου το 1978 από τους Steptoe και Edwards, γεγονός που σήμανε την αυγή της Αναπαραγωγικής Ιατρικής. Η χορήγηση φαρμάκων που εφαρμόστηκε τα επόμενα χρόνια αύξησε τον αριθμό των ωαρίων που συλλέγουμε, με αποτέλεσμα αύξηση του ποσοστού επιτυχίας ανά κύκλο εξωσωματικής γονιμοποίησης, όμως, εμφάνισε και κάποια μειονεκτήματα, όπως το Σύνδρομο Υπερδιέγερσης των Ωοθηκών και τις πολύδυμες κυήσεις, λόγω χορήγησης αυξημένων δόσεων φαρμάκων ή λόγω μεταφοράς περισσότερων του ενός εμβρύων, αντίστοιχα.